প্রাকৃতিক বিপর্যয়ের কারণে প্রায়শই ক্ষতিগ্রস্থ হয় চা বাগানের চা গাছগুলি। এছাড়াও চা বাগানের মধ্যে অবস্থিত মশাও চা গাছের বৃদ্ধি ব্যহত করে। এই মশারা চা গাছের পাতার রস খেয়ে চা পাতা নষ্ট করে দেয়। এর ফলে আস্তে আস্তে পুরো চা গাছটিই নষ্ট হতে থাকে।
প্রাকৃতিক বিপর্যয়গুলি একদিকে যেমন ক্ষতিকর প্রভাব ফেলে তেমনি বজ্রপাতের ফলে চা গাছের বিশেষ উন্নতি হয়। সম্প্রতি অভিজ্ঞ টি প্ল্যান্টাররা জানিয়েছেন যে, বজ্রপাত চা গাছের জন্য আদর্শ।
কারণ হিসেবে তারা বলেছেন যে, বজ্রপাতের ফলে মাটি তার প্রয়োজনীয় উপাদানগুলির যোগান পায়। কারণ বজ্রপাত যখন ঘটে তখন বাতাসে অবস্থিত নাইট্রোজেন কণাগুলি ভেঙ্গে যায় তারপর তা নাইট্রেড আকারে বৃষ্টির জলের সঙ্গে মাটির ভেতরে প্রবেশ করে। এরপর মাটি থেকে সেই নাইট্রোজেনের উপাদানগুলোকে চা গাছগুলো গ্রহণ করে। এটি একটি বৈজ্ঞানিক প্রক্রিয়া যা মৃত্তিকা ও উদ্ভিদ বিজ্ঞানের সঙ্গে জড়িত।